Protein–RNA interactions for Protein: P84244

H3f3a, Histone H3.3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3f3aP84244 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm9415-201ENSMUST00000200462 1321 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm10548-201ENSMUST00000097631 2629 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Gm36987-201ENSMUST00000194704 2979 ntBASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Srp54b-202ENSMUST00000218879 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.8
H3f3aP84244 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm37969-201ENSMUST00000195777 3409 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ftsj1-201ENSMUST00000033513 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fasn-205ENSMUST00000206589 8333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm10479-201ENSMUST00000101568 318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pmp22-203ENSMUST00000108701 723 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Use1-202ENSMUST00000110053 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12616-201ENSMUST00000118594 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm5542-201ENSMUST00000195485 1089 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ifnab-201ENSMUST00000071378 1058 ntAPPRIS P1 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Susd5-201ENSMUST00000135338 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 AC131586.1-201ENSMUST00000228844 2964 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
H3f3aP84244 Cep250-202ENSMUST00000094421 7919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
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