Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Zbtb25-202ENSMUST00000176102 2707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Exoc4-202ENSMUST00000090381 2598 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cacna1s-204ENSMUST00000160641 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm17980-201ENSMUST00000217977 2349 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 9430064I24Rik-201ENSMUST00000206516 2669 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Dhx34-207ENSMUST00000163968 3801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm26953-204ENSMUST00000212526 553 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rnh1-201ENSMUST00000106033 2091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Anxa7-201ENSMUST00000065504 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 C130013H08Rik-201ENSMUST00000197569 3692 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mybpc3-203ENSMUST00000169776 4163 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Vars2-201ENSMUST00000043674 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Arfgap3-202ENSMUST00000226124 2461 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Fam170a-201ENSMUST00000039121 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm4884-201ENSMUST00000164422 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ltbp2-201ENSMUST00000002073 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Marveld2-201ENSMUST00000022137 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Mir3102-201ENSMUST00000175555 104 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm25890-201ENSMUST00000177643 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rnu1b2-201ENSMUST00000178073 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rnu1b1-201ENSMUST00000178250 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm22614-201ENSMUST00000178300 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm6450-201ENSMUST00000200896 574 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Rpl9-ps6-201ENSMUST00000078034 691 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm22042-201ENSMUST00000082989 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm26110-201ENSMUST00000083971 165 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Zfyve1-201ENSMUST00000048319 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Zfp940-202ENSMUST00000108223 2560 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Chrm1-202ENSMUST00000163785 6271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 AI593442-201ENSMUST00000098768 5615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Myh2-201ENSMUST00000018641 6018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Irx1P81068 Gm37451-201ENSMUST00000194718 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms