Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Adgrg5-201ENSMUST00000074570 2802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Anapc4-201ENSMUST00000031072 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Myh11-201ENSMUST00000090287 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Emc1-201ENSMUST00000042096 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dock6-207ENSMUST00000217336 6880 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Pitpnc1-202ENSMUST00000103064 6329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 App-206ENSMUST00000227723 8167 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Fam163a-201ENSMUST00000015628 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Col6a6-203ENSMUST00000166431 7098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Hmgn2-208ENSMUST00000136327 772 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 1700065I16Rik-201ENSMUST00000185277 512 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm44216-201ENSMUST00000203942 157 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tex29-205ENSMUST00000209692 884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AC123694.1-201ENSMUST00000219525 644 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AC158392.3-201ENSMUST00000224271 1284 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 AC122035.1-201ENSMUST00000227576 1016 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Nudt2-201ENSMUST00000030154 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Otx2P80206 1700030J22Rik-201ENSMUST00000070577 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Fcrl1-203ENSMUST00000167200 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 E330023G01Rik-201ENSMUST00000186387 1483 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Ice2-202ENSMUST00000117246 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm13284-201ENSMUST00000121020 547 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pax4-202ENSMUST00000164519 1229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Hcrtr1-204ENSMUST00000164887 1251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Pax4-203ENSMUST00000171089 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 2700099C18Rik-202ENSMUST00000182402 1275 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Otx2P80206 Gm37365-201ENSMUST00000193109 409 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
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