Protein–RNA interactions for Protein: P63089

Ptn, Pleiotrophin, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtnP63089 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm14397-201ENSMUST00000124728 576 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Cacna1c-224ENSMUST00000219018 7516 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 E130308A19Rik-202ENSMUST00000070150 10856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Otof-201ENSMUST00000074171 7129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ntrk2-201ENSMUST00000079828 8744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
PtnP63089 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Foxp1-201ENSMUST00000074346 2118 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ippk-202ENSMUST00000220447 4421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Sel1l-204ENSMUST00000167466 5544 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Mobp-202ENSMUST00000093773 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
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PtnP63089 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PtnP63089 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
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PtnP63089 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Psma7-201ENSMUST00000029082 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Wdr60-201ENSMUST00000039349 3721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tnk2-207ENSMUST00000115126 4358 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Irak4-202ENSMUST00000109248 3437 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Ddx11-201ENSMUST00000163605 4149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Atp1a2-202ENSMUST00000097464 3186 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm32856-201ENSMUST00000212145 3767 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Cuzd1-201ENSMUST00000046611 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Tpm1-210ENSMUST00000113693 1054 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm11772-201ENSMUST00000136542 532 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Gm22902-201ENSMUST00000158488 302 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
PtnP63089 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms