Protein–RNA interactions for Protein: P61759

Vbp1, Prefoldin subunit 3, mousemouse

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Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vbp1P61759 Nrp2-202ENSMUST00000063594 6342 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Acsm5-205ENSMUST00000207440 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Zfp780b-201ENSMUST00000081618 3004 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 6430573F11Rik-203ENSMUST00000147525 5820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm17227-202ENSMUST00000170286 1016 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm20125-205ENSMUST00000208005 1979 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Sfxn2-201ENSMUST00000026011 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ano2-204ENSMUST00000160496 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Bcl2l11-201ENSMUST00000019281 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Rpgrip1-201ENSMUST00000111600 4565 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Fam234a-202ENSMUST00000118487 2629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tra2b-204ENSMUST00000161286 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Sypl-201ENSMUST00000020885 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Thsd7b-202ENSMUST00000073527 6213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 4732487G21Rik-201ENSMUST00000181495 2664 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Nlgn3-201ENSMUST00000065858 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Atg16l2-201ENSMUST00000120267 6459 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cherp-207ENSMUST00000212991 3646 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gtf2h3-201ENSMUST00000031333 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Optc-201ENSMUST00000124051 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
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Vbp1P61759 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gphn-201ENSMUST00000052472 3570 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cacna1c-210ENSMUST00000187474 6911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Gm44798-201ENSMUST00000208123 2410 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Bfar-201ENSMUST00000023365 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Vbp1P61759 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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