Protein–RNA interactions for Protein: P61406

Smg6, Telomerase-binding protein EST1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg6P61406 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm5833-202ENSMUST00000190707 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm38271-201ENSMUST00000192296 1603 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Evi2a-201ENSMUST00000103236 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Shtn1-201ENSMUST00000047511 4081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Eif4g2-206ENSMUST00000161051 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Acly-201ENSMUST00000007131 4393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mnd1-201ENSMUST00000047368 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mir483-201ENSMUST00000093631 73 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Adam19-201ENSMUST00000011400 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rhox3c-202ENSMUST00000115189 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 E230034D01Rik-201ENSMUST00000214440 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm25201-201ENSMUST00000083093 170 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rhox3a2-201ENSMUST00000096459 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Smg6P61406 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms