Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Susd4-201ENSMUST00000085724 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Zeb2-212ENSMUST00000176438 9124 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Slitrk4-202ENSMUST00000114679 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Il1rn-202ENSMUST00000114485 728 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm11980-201ENSMUST00000121445 986 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm13445-201ENSMUST00000121664 307 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm12682-201ENSMUST00000144637 1081 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm17221-201ENSMUST00000163909 481 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm17073-201ENSMUST00000168069 556 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mir7035-201ENSMUST00000184713 82 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Abhd14a-204ENSMUST00000185334 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm43249-201ENSMUST00000200464 458 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Serhl-205ENSMUST00000166427 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 D130043K22Rik-201ENSMUST00000006893 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Snap25P60879 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Adgrl3-210ENSMUST00000119788 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Pemt-202ENSMUST00000102692 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Srpk1-202ENSMUST00000114767 445 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Zfp426-202ENSMUST00000115562 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mrgpra2a-201ENSMUST00000159004 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm16271-201ENSMUST00000162837 220 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm7719-201ENSMUST00000182374 975 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 E230029C05Rik-203ENSMUST00000208028 2066 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Myf6-201ENSMUST00000044210 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Slc39a6-201ENSMUST00000070726 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Camta1-201ENSMUST00000049790 8423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Map3k2-201ENSMUST00000096575 10791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mad1l1-201ENSMUST00000031534 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Col18a1-203ENSMUST00000105409 4791 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Mterf3-201ENSMUST00000021991 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Snap25P60879 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms