Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 Tnfrsf9-202ENSMUST00000060901 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Eif5-213ENSMUST00000222388 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm13871-202ENSMUST00000107319 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm11757-202ENSMUST00000107321 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 C530043K16Rik-201ENSMUST00000201865 3109 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Stxbp5l-201ENSMUST00000023526 3344 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Scnn1g-201ENSMUST00000000221 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Kcnma1-207ENSMUST00000172099 3354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm23745-201ENSMUST00000104230 125 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm12947-201ENSMUST00000116114 420 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Fthl17-ps2-201ENSMUST00000122268 528 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm24346-201ENSMUST00000158712 194 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Olfr527-201ENSMUST00000172230 978 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Cdhr4-208ENSMUST00000176373 492 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm37860-201ENSMUST00000195380 1034 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm45094-201ENSMUST00000207013 617 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm45680-201ENSMUST00000211135 214 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 AC142266.1-201ENSMUST00000228107 415 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Elob-201ENSMUST00000069579 508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Nt5dc1-202ENSMUST00000099973 761 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm38312-201ENSMUST00000195426 1746 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Snx27-208ENSMUST00000200642 1308 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Nphp4P59240 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Samd13-202ENSMUST00000125965 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Pex2-201ENSMUST00000059021 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Pou2f1-202ENSMUST00000069609 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm38192-201ENSMUST00000194364 1847 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm22594-201ENSMUST00000104251 130 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Tnfrsf14-201ENSMUST00000123514 1018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm16288-201ENSMUST00000137940 367 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Park2-203ENSMUST00000168593 735 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm7939-201ENSMUST00000201233 1050 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 BC080696-201ENSMUST00000202858 1218 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Ppm1a-205ENSMUST00000222896 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 D730050B12Rik-201ENSMUST00000223149 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 AC158986.2-201ENSMUST00000227487 618 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Ngp-201ENSMUST00000035061 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Olfr372-201ENSMUST00000093434 1016 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Ikzf4-201ENSMUST00000133342 5150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Rpap2-205ENSMUST00000112655 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Nphp4P59240 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Ccdc151-202ENSMUST00000115336 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm42833-201ENSMUST00000196019 2124 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Dmrtc1b-201ENSMUST00000101324 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Dmrtc1b-202ENSMUST00000113609 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Sgcg-202ENSMUST00000121148 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm25288-201ENSMUST00000122800 265 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 1810021B22Rik-201ENSMUST00000150364 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Nphp4P59240 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms