Protein–RNA interactions for Protein: P47758

Srprb, Signal recognition particle receptor subunit beta, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrprbP47758 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 5830417I10Rik-201ENSMUST00000135913 6190 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Nhp2-202ENSMUST00000127405 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm23771-201ENSMUST00000178702 110 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm8197-202ENSMUST00000193422 934 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC165260.2-203ENSMUST00000224237 336 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Tmem231-201ENSMUST00000034429 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Mrpl18-201ENSMUST00000079121 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Cd320-202ENSMUST00000087559 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SrprbP47758 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Lsamp-206ENSMUST00000187695 3411 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Adora1-203ENSMUST00000169927 4581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Kirrel2-201ENSMUST00000045817 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Ostm1-202ENSMUST00000105497 770 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Nudt6-203ENSMUST00000108117 879 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Siglech-205ENSMUST00000165045 1062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Dtx3l-202ENSMUST00000114885 2648 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SrprbP47758 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cyp4x1-201ENSMUST00000051400 1524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 AC027700.1-201ENSMUST00000213965 370 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 AC101677.2-201ENSMUST00000218733 741 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 CT030637.1-201ENSMUST00000228016 669 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SrprbP47758 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms