Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 4930486L24Rik-201ENSMUST00000091569 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm11434-201ENSMUST00000122379 629 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 AC155712.2-201ENSMUST00000220398 643 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Casc1-203ENSMUST00000111728 2682 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Wdr82-201ENSMUST00000020490 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Slc38a5-202ENSMUST00000115590 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mybpc3-202ENSMUST00000137942 4134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Kbtbd12-206ENSMUST00000184878 3351 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nlrp5-ps-202ENSMUST00000173220 1294 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Klk1b19-ps-201ENSMUST00000205322 696 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 D9Wsu149-201ENSMUST00000214169 594 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Igfn1-203ENSMUST00000166193 8989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Ankrd31-203ENSMUST00000208758 5859 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Wdr36-201ENSMUST00000053663 3281 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Gm17281-201ENSMUST00000180732 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
ItgavP43406 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Slc6a1-201ENSMUST00000032454 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
ItgavP43406 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms