Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pax5-203ENSMUST00000107825 1445 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm29245-201ENSMUST00000187332 1416 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Acvrl1-201ENSMUST00000000542 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Bahcc1-201ENSMUST00000044985 10726 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Ccnt2-201ENSMUST00000027587 6738 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Odf2l-204ENSMUST00000106192 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm29418-201ENSMUST00000186162 647 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pdcd5-ps-201ENSMUST00000191699 381 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Fam151b-201ENSMUST00000040106 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Uqcc1-203ENSMUST00000109632 2313 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 S1pr2-201ENSMUST00000054197 6394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Kcnh5-201ENSMUST00000042299 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Pcdh12-203ENSMUST00000194012 2702 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Zbtb21-201ENSMUST00000052089 5410 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm45272-203ENSMUST00000211111 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
ThpoP40226 Gm15725-201ENSMUST00000119947 1090 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms