Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp872-202ENSMUST00000178901 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pcdh15-233ENSMUST00000191709 5346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ipo7-201ENSMUST00000084731 4763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Atp11c-201ENSMUST00000033480 5939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sipa1l3-215ENSMUST00000183096 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sipa1l3-201ENSMUST00000085809 7713 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.85□□□□□ -0.83
Cd28P31041 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm15883-201ENSMUST00000153562 1690 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm46355-201ENSMUST00000221434 1671 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Nckap5-212ENSMUST00000162877 2630 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ube2a-202ENSMUST00000200835 911 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Ube2a-209ENSMUST00000202991 715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Cbx1-202ENSMUST00000079702 912 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gfm2-201ENSMUST00000022170 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Abcg1-201ENSMUST00000024829 3610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Myo5a-201ENSMUST00000123128 11702 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Sema3b-203ENSMUST00000102530 3410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
Cd28P31041 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Myh10-204ENSMUST00000108673 1315 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Cenpj-203ENSMUST00000225951 4756 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Pdpk1-202ENSMUST00000102927 7161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Phf8-203ENSMUST00000112662 3732 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Abhd12b-203ENSMUST00000169156 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Msrb3-201ENSMUST00000092143 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Bicd1-203ENSMUST00000111513 4049 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Tubb2b-201ENSMUST00000075774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Dip2c-202ENSMUST00000169960 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Cd28P31041 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms