Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

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Length 463 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 Psd4-201ENSMUST00000056641 4748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm26783-201ENSMUST00000181197 2377 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Stx5a-219ENSMUST00000177373 995 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Snhg8-201ENSMUST00000196466 448 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Krtap19-9b-201ENSMUST00000077715 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rnf183-201ENSMUST00000079420 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4732471J01Rik-204ENSMUST00000206436 2430 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Hps1-209ENSMUST00000162061 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Megf8-201ENSMUST00000128119 10040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ptpru-202ENSMUST00000097860 3365 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm14154-201ENSMUST00000142642 579 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Commd4-201ENSMUST00000065358 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Aar2-202ENSMUST00000109570 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ikzf4-203ENSMUST00000221150 2213 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm44152-201ENSMUST00000205007 1691 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Arhgap24-202ENSMUST00000073302 3151 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 4933406M09Rik-201ENSMUST00000162187 1768 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Sod3-201ENSMUST00000101208 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 AC129336.2-201ENSMUST00000218053 3086 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm12036-201ENSMUST00000120008 530 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gm6771-201ENSMUST00000182716 1001 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Gpx1-204ENSMUST00000193987 653 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
RxrgP28705 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.2 ms