Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

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Length 467 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm12333-201ENSMUST00000155508 2669 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 1700088E04Rik-201ENSMUST00000169604 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm6439-201ENSMUST00000199849 862 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Prdx2-201ENSMUST00000005292 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Clcn4-201ENSMUST00000000619 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8320-201ENSMUST00000177584 1762 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8303-201ENSMUST00000178371 1762 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm8331-201ENSMUST00000178433 1762 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Ehmt1-203ENSMUST00000102938 4680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
RxraP28700 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxraP28700 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.27□□□□□ -0.6
RxraP28700 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxraP28700 Slc13a5-205ENSMUST00000208056 3111 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxraP28700 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.6
RxraP28700 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pdzk1-203ENSMUST00000107070 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Eef1d-207ENSMUST00000116440 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm9089-201ENSMUST00000122027 526 ntBASIC11.27□□□□□ -0.61
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RxraP28700 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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RxraP28700 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
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RxraP28700 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Tex2-202ENSMUST00000103070 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mrrf-201ENSMUST00000028250 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Armcx4-201ENSMUST00000124226 7996 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Srsf6-203ENSMUST00000130411 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Olfr1413-202ENSMUST00000214239 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gm4294-201ENSMUST00000105169 614 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.26□□□□□ -0.61
RxraP28700 Lamr1-ps1-201ENSMUST00000119759 874 ntBASIC11.26□□□□□ -0.61
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