Protein–RNA interactions for Protein: P13373

Vpreb2, Immunoglobulin omega chain, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb2P13373 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr243-202ENSMUST00000215723 4735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Vmn1r38-202ENSMUST00000227493 3486 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AU019823-201ENSMUST00000131351 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tirap-203ENSMUST00000176531 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pms2-209ENSMUST00000148011 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cklf-202ENSMUST00000098464 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sox5os1-201ENSMUST00000156994 1585 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Atl2-201ENSMUST00000068282 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Espl1-201ENSMUST00000064924 6630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Smpd4-219ENSMUST00000170366 2256 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 CT010498.2-201ENSMUST00000225690 1659 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dctn1-203ENSMUST00000113913 4163 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfp24-201ENSMUST00000066497 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm26685-201ENSMUST00000181831 2023 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tfap2b-201ENSMUST00000027059 5863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rest-201ENSMUST00000080359 7004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Th-202ENSMUST00000105929 1950 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm23085-201ENSMUST00000157849 293 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm29233-201ENSMUST00000190311 281 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm270-201ENSMUST00000223010 976 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Kif13b-203ENSMUST00000224503 8865 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Ehmt1-210ENSMUST00000147147 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nfya-202ENSMUST00000078800 3653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gpr155-204ENSMUST00000112044 4201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Igtp-203ENSMUST00000168280 1832 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AC138329.2-201ENSMUST00000225579 1842 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Lhfpl1-201ENSMUST00000040084 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Diaph1-201ENSMUST00000025337 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Gm20658-201ENSMUST00000175871 1489 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Zfhx2-201ENSMUST00000036328 10397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 Sirt2-209ENSMUST00000170068 1585 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Vpreb2P13373 AL732309.1-201ENSMUST00000228627 2045 ntAPPRIS P1 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms