Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

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Length 250 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zfp286-211ENSMUST00000207597 1668 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vsnl1-202ENSMUST00000220506 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm34006-202ENSMUST00000216467 1918 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC132384.7-201ENSMUST00000220198 1391 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC169038.1-201ENSMUST00000227378 1352 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ankmy2-201ENSMUST00000041640 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC158777.1-201ENSMUST00000226216 1724 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gatb-202ENSMUST00000107672 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rnf183-203ENSMUST00000107455 1432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tulp2-210ENSMUST00000210868 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm23987-201ENSMUST00000117039 129 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr1296-ps1-201ENSMUST00000117697 939 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15568-201ENSMUST00000118589 1213 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm14227-201ENSMUST00000119431 629 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm15077-201ENSMUST00000122344 362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm25569-201ENSMUST00000157175 131 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm16589-201ENSMUST00000159522 918 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Vmn2r-ps124-201ENSMUST00000176236 903 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Obox6-ps1-201ENSMUST00000176658 1042 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26801-201ENSMUST00000180591 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18800-201ENSMUST00000186588 637 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm7135-201ENSMUST00000187538 675 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18303-201ENSMUST00000190055 1176 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18010-201ENSMUST00000203553 202 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm18988-201ENSMUST00000205601 746 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm29918-201ENSMUST00000205635 138 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr490-201ENSMUST00000210114 945 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Olfr864-ps1-201ENSMUST00000212664 930 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm33838-201ENSMUST00000214038 786 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC117769.1-201ENSMUST00000224716 1120 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rnf181-202ENSMUST00000069595 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Rps8-ps4-201ENSMUST00000092523 612 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4631405J19Rik-201ENSMUST00000099699 1225 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4921534H16Rik-201ENSMUST00000162370 1392 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Slc1a2-203ENSMUST00000111212 1957 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 4930480E11Rik-201ENSMUST00000035626 1486 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 C030005K06Rik-201ENSMUST00000129164 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Eif2c5-201ENSMUST00000125609 1416 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Hoxb4P10284 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms