Protein–RNA interactions for Protein: P04342

Crygd, Gamma-crystallin D, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrygdP04342 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Rpp38-201ENSMUST00000062672 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Smarca2-209ENSMUST00000176030 5862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Zbtb49-201ENSMUST00000094833 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Olfr315-202ENSMUST00000203256 2458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm18986-201ENSMUST00000216029 1986 ntBASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Nrxn1-215ENSMUST00000173917 1439 ntTSL 2 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tuft1-204ENSMUST00000196733 2555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cpped1-202ENSMUST00000096272 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Plagl1-203ENSMUST00000121766 3897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gpr161-201ENSMUST00000111450 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 D17H6S53E-201ENSMUST00000061859 2142 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Adh6-ps1-201ENSMUST00000171054 2789 ntTSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.44□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cdc7-204ENSMUST00000118261 3129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Acsl6-202ENSMUST00000064690 1988 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tnfaip3-201ENSMUST00000019997 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm13791-201ENSMUST00000123263 608 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Bach2it1-201ENSMUST00000133451 481 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm11211-201ENSMUST00000143618 359 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 4930477O15Rik-201ENSMUST00000196484 1089 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm29961-201ENSMUST00000214692 644 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm5468-202ENSMUST00000227851 682 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gdap2-201ENSMUST00000029459 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cc2d1a-202ENSMUST00000117424 3262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 5930412G12Rik-201ENSMUST00000091324 2403 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm26660-202ENSMUST00000223620 4112 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Vamp5-203ENSMUST00000206154 2619 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cisd2-201ENSMUST00000029815 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
CrygdP04342 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms