Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC125539.1-201ENSMUST00000227423 622 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rpl34-202ENSMUST00000079085 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm31938-201ENSMUST00000218081 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cacna1s-201ENSMUST00000112064 6251 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Dzip1l-201ENSMUST00000078367 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Meaf6-205ENSMUST00000154689 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm8111-201ENSMUST00000117659 987 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12446-201ENSMUST00000123933 798 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm12951-201ENSMUST00000150216 434 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm17019-201ENSMUST00000167908 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm27003-201ENSMUST00000182590 497 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm19353-201ENSMUST00000184561 445 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm5363-201ENSMUST00000211927 938 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Olfr959-201ENSMUST00000079178 1055 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Mak-202ENSMUST00000070193 2937 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Gm43435-201ENSMUST00000199996 1438 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
Tgfb1P04202 Cyp2a12-201ENSMUST00000075552 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
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