Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Hbb-y-201ENSMUST00000033229 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Sema3g-201ENSMUST00000090180 4540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm21358-201ENSMUST00000191645 1659 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tia1-211ENSMUST00000130967 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pcnx-201ENSMUST00000021567 12139 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Olfr269-ps1-201ENSMUST00000120783 302 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm7183-201ENSMUST00000213870 1005 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC099645.1-201ENSMUST00000226476 1105 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Olfr76-201ENSMUST00000087822 1048 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Oc90-202ENSMUST00000079776 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pla2g6-203ENSMUST00000172403 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Mmp19-203ENSMUST00000219404 2236 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tmx3-201ENSMUST00000025515 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Mkx-201ENSMUST00000079788 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm37634-201ENSMUST00000195700 650 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Dysf-205ENSMUST00000113823 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Lnx1O70263 AC159195.3-201ENSMUST00000225162 2211 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 158.8 ms