Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Smoc1-202ENSMUST00000110347 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Rbms2-202ENSMUST00000099139 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zfp551-201ENSMUST00000080348 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Sepsecs-201ENSMUST00000031069 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cphx3-201ENSMUST00000163305 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm42815-201ENSMUST00000198787 1470 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Crat-203ENSMUST00000102855 4224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 AC134913.1-201ENSMUST00000224563 504 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Mt4-201ENSMUST00000034207 398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Tcam1-201ENSMUST00000044462 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ogfod1-202ENSMUST00000093301 5141 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Drosha-207ENSMUST00000169061 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zfp563-201ENSMUST00000131722 1938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm13535-201ENSMUST00000118714 1884 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Adra1a-202ENSMUST00000159068 4282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Hist4h4-201ENSMUST00000179285 2863 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm29154-258ENSMUST00000217560 1733 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Tmem269-201ENSMUST00000030394 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Tmem92-203ENSMUST00000162809 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zfp873-204ENSMUST00000210325 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm19938-201ENSMUST00000192692 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm37266-201ENSMUST00000193802 2287 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Rph3a-204ENSMUST00000202406 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 AC125351.1-201ENSMUST00000221438 2223 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cnga2-201ENSMUST00000006020 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Epb41-206ENSMUST00000105974 4844 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm28469-201ENSMUST00000186374 2166 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm28134-201ENSMUST00000188690 2166 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm37075-201ENSMUST00000191888 2166 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm37574-201ENSMUST00000194264 2166 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zfp264-202ENSMUST00000208781 2801 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Dnmbp-203ENSMUST00000212048 4186 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 D030045P18Rik-201ENSMUST00000213245 1892 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Nup210-201ENSMUST00000032179 7037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cpa5-202ENSMUST00000115138 1778 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Aloxe3-201ENSMUST00000021268 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Zfp112-201ENSMUST00000005413 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm9929-201ENSMUST00000171747 1671 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Aasdh-202ENSMUST00000120963 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 St3gal6-207ENSMUST00000137035 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Slc2a9-202ENSMUST00000067872 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Cnga3-204ENSMUST00000195272 2197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm26792-201ENSMUST00000180538 2799 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 AC154806.5-202ENSMUST00000227217 1443 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Celf2-223ENSMUST00000182851 3587 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Smcr8-202ENSMUST00000102667 3544 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Olfr510-202ENSMUST00000213979 2898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Bcorl1-203ENSMUST00000136348 7446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Arhgef10l-205ENSMUST00000105798 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Igfbp2-202ENSMUST00000120564 991 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PrkcshO08795 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms