Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

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Length 144 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Umod-201ENSMUST00000033263 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Hist1h2bk-201ENSMUST00000110455 476 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Gm14807-201ENSMUST00000116640 983 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm5133-201ENSMUST00000118940 1255 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm11340-201ENSMUST00000119226 412 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Hk3-202ENSMUST00000123097 2896 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Celf4-201ENSMUST00000025117 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ikbip-201ENSMUST00000020149 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Rbl2-210ENSMUST00000211136 4504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 6820426E19Rik-201ENSMUST00000204274 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 1700082M22Rik-201ENSMUST00000067136 2022 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Lrp8-203ENSMUST00000106732 2648 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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Gm2056J3QQ02 1700001K19Rik-201ENSMUST00000070659 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Esco2-201ENSMUST00000022613 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Lsamp-208ENSMUST00000189358 2766 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Tfdp2-204ENSMUST00000179065 2213 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Rtn3-202ENSMUST00000065304 5030 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Cad-204ENSMUST00000201182 6529 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Atic-201ENSMUST00000027384 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Gm2056J3QQ02 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
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