Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Gm34868-201ENSMUST00000218341 530 ntTSL 3 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-206ENSMUST00000111244 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ggct-202ENSMUST00000131475 3960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Nfam1-202ENSMUST00000100377 2881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 3632454L22Rik-202ENSMUST00000153610 2872 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc6a16-203ENSMUST00000213347 2865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 P2ry14-202ENSMUST00000091112 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tdp1-207ENSMUST00000153627 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Wdr93-201ENSMUST00000035622 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pdp1-202ENSMUST00000095144 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rrp7a-201ENSMUST00000018184 4363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Srgap2-204ENSMUST00000186543 3533 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Trim34a-201ENSMUST00000060315 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC159819.3-201ENSMUST00000216940 1837 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Apobec3-204ENSMUST00000175714 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Vmn2r-ps97-201ENSMUST00000222427 1970 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 BC005624-201ENSMUST00000028205 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Myo9a-205ENSMUST00000135298 12198 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ilf3-213ENSMUST00000216892 3684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Snapc1-201ENSMUST00000021532 6275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC132467.2-201ENSMUST00000226306 2253 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Mmel1-201ENSMUST00000079269 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ighg3-202ENSMUST00000223179 2414 ntAPPRIS P5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pgbd5-206ENSMUST00000172566 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm43807-201ENSMUST00000200678 1781 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Drc3-204ENSMUST00000108723 1917 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gpm6b-201ENSMUST00000060210 2858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4930562F07Rik-201ENSMUST00000028061 830 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc26a1-202ENSMUST00000119270 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Slc26a1-204ENSMUST00000163328 3015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rdh16f1-201ENSMUST00000128247 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sfi1-210ENSMUST00000140846 3604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfm4-203ENSMUST00000228749 2801 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Zcchc8-201ENSMUST00000031376 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Rffl-204ENSMUST00000093975 3575 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Bcl2l11-202ENSMUST00000089634 2301 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Stxbp5l-203ENSMUST00000114780 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Dnm2-203ENSMUST00000115404 3455 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Sncaip-201ENSMUST00000025413 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Alox5-207ENSMUST00000170186 1929 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Glyctk-201ENSMUST00000036382 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Atxn1-201ENSMUST00000091628 10569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Pds5a-201ENSMUST00000031104 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Lipa-201ENSMUST00000049572 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Smim18J3QNP2 Lrit3-201ENSMUST00000179187 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Xpo5-201ENSMUST00000087031 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 R3hdm2-201ENSMUST00000064793 4175 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Msln-201ENSMUST00000075884 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tnc-203ENSMUST00000107372 7106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Upb1-201ENSMUST00000039925 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Nupl1-201ENSMUST00000225805 3602 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Gm11801-201ENSMUST00000117807 746 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Smim18J3QNP2 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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