Protein–RNA interactions for Protein: J3QMK2

Bbip1, BBSome-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 67 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbip1J3QMK2 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Sgsm1-202ENSMUST00000057209 4339 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Arhgef2-207ENSMUST00000175903 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm26857-201ENSMUST00000181580 3347 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tor1aip2-201ENSMUST00000060404 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Cdkl2-201ENSMUST00000069937 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pcdh11x-202ENSMUST00000113358 8607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Peg10-201ENSMUST00000166678 6662 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Pum1-201ENSMUST00000030315 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm16219-201ENSMUST00000120096 274 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 CT009713.8-201ENSMUST00000225448 560 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Olfr1395-201ENSMUST00000059379 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Nwd1-201ENSMUST00000093427 7840 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Gm21939-201ENSMUST00000221137 2773 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Ank3-242ENSMUST00000183261 4999 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Trim45-201ENSMUST00000037409 4612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Bbip1J3QMK2 Etfrf1-201ENSMUST00000039729 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Nhsl1-202ENSMUST00000100054 6795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Mthfsd-201ENSMUST00000047282 8312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Acan-201ENSMUST00000032835 7355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Nampt-201ENSMUST00000020886 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 2610005L07Rik-202ENSMUST00000140111 4009 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Atg2a-201ENSMUST00000045351 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Prdm10-204ENSMUST00000215499 6772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Card14-202ENSMUST00000106250 4206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Bbip1J3QMK2 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.4 ms