Protein–RNA interactions for Protein: F6XQQ1

Gm10378, Predicted gene 10378 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10378F6XQQ1 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm7504-201ENSMUST00000201449 424 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tnpo3-201ENSMUST00000012679 4251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Oxct1-201ENSMUST00000110690 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Galr1-201ENSMUST00000065224 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ces3b-202ENSMUST00000093221 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ift43-205ENSMUST00000222821 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Mir219a-1-201ENSMUST00000083621 110 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cma2-201ENSMUST00000089555 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Hyal1-202ENSMUST00000112387 2706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Fip1l1-204ENSMUST00000113536 4769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Nfx1-201ENSMUST00000030133 4349 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm44369-201ENSMUST00000204543 2175 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm11033-203ENSMUST00000156185 2321 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Stk38-201ENSMUST00000009138 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ahnak2-201ENSMUST00000101010 2821 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm15891-201ENSMUST00000127307 611 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm12589-201ENSMUST00000153767 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ccl19-ps3-201ENSMUST00000179634 324 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm12407-201ENSMUST00000180219 324 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Try10-201ENSMUST00000072103 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Colq-201ENSMUST00000112027 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm18642-201ENSMUST00000206642 1400 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 4632404M16Rik-201ENSMUST00000197326 2882 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Synpo2l-201ENSMUST00000057090 4394 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm10378F6XQQ1 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC12.25□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms