Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm30946-201ENSMUST00000198288 724 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 BC028471-201ENSMUST00000200937 520 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm43969-201ENSMUST00000204833 535 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm45542-201ENSMUST00000210456 438 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 E230014E18Rik-201ENSMUST00000215920 859 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gm46224-201ENSMUST00000220221 1242 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Id2-203ENSMUST00000222667 958 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Hddc2-201ENSMUST00000000304 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Triap1-201ENSMUST00000031508 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Vmn1r222-201ENSMUST00000077116 1054 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Grap2-201ENSMUST00000043149 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cfap74-209ENSMUST00000151083 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pparg-204ENSMUST00000203732 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Onecut1-201ENSMUST00000056006 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Eif4enif1-204ENSMUST00000120721 2952 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Git2-202ENSMUST00000086564 2984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pafah1b2-201ENSMUST00000172450 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Pop4-201ENSMUST00000032585 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Cyp2s1-201ENSMUST00000043314 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Gimap5-201ENSMUST00000055558 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
Gm6880A3KG45 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm12756-201ENSMUST00000126294 599 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 A230006K03Rik-202ENSMUST00000154958 901 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm9487-201ENSMUST00000216600 472 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 AC137871.1-201ENSMUST00000228278 475 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 1810013D15Rik-201ENSMUST00000029827 300 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm9758-201ENSMUST00000035980 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4930572O03Rik-201ENSMUST00000092696 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm6268-201ENSMUST00000115253 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Smok4a-201ENSMUST00000074512 1455 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ces2e-201ENSMUST00000034355 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gpr17-201ENSMUST00000064016 5195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Anxa3-205ENSMUST00000198631 1523 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Sec14l4-201ENSMUST00000019512 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Eml5-201ENSMUST00000065716 9482 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Sez6l-201ENSMUST00000075387 6055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tbl2-204ENSMUST00000153183 7488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Tardbp-210ENSMUST00000172073 6513 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Nicn1-201ENSMUST00000035227 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Gm6880A3KG45 Bpi-201ENSMUST00000065039 1926 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms