Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Gm26672-201ENSMUST00000180922 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Slamf7-204ENSMUST00000194531 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AI854703-201ENSMUST00000095938 3517 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tcp10a-203ENSMUST00000129709 1778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Pde6c-202ENSMUST00000112329 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Stox2-209ENSMUST00000211882 9696 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Hyal2-206ENSMUST00000195681 2968 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Inpp5j-201ENSMUST00000044507 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC154171.2-201ENSMUST00000225219 2652 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Sema4c-202ENSMUST00000191642 3892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Mir1896-201ENSMUST00000122641 81 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tro-208ENSMUST00000164071 891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm20662-201ENSMUST00000176356 601 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ccin-201ENSMUST00000095107 1941 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ifit1bl1-202ENSMUST00000168254 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Dysf-212ENSMUST00000203695 6504 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Igsf3-202ENSMUST00000195164 3876 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Zfp593-201ENSMUST00000030644 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Shank2-202ENSMUST00000105900 8169 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Plcg1-202ENSMUST00000103115 4435 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Wac-216ENSMUST00000171486 1608 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf9-201ENSMUST00000030808 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka6-203ENSMUST00000096348 4151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm11949-201ENSMUST00000117640 372 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Gm4846-201ENSMUST00000143922 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Atp8b5A3FIN4 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms