Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2V6

Hdac5, Histone deacetylase 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac5Q9Z2V6 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rabggtb-202ENSMUST00000167111 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Wnt16-202ENSMUST00000128245 3285 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbms2-201ENSMUST00000092033 1481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43064-201ENSMUST00000199710 3144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm34816-201ENSMUST00000193363 502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC158388.1-201ENSMUST00000225441 256 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rnf43-203ENSMUST00000121782 2640 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Prr3-203ENSMUST00000172429 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Bmp5-201ENSMUST00000012281 3822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rgma-202ENSMUST00000119206 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Wwtr1-201ENSMUST00000029380 4697 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm38194-201ENSMUST00000194529 2211 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Nsun7-204ENSMUST00000202994 3632 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Pabpc4-203ENSMUST00000106241 3050 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac5Q9Z2V6 Gm20918-202ENSMUST00000188637 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
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Hdac5Q9Z2V6 AC120394.2-201ENSMUST00000213905 702 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 AC153522.1-201ENSMUST00000220047 1090 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Olfr1466-201ENSMUST00000075868 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Eid3-201ENSMUST00000211623 1305 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 1700019D03Rik-202ENSMUST00000114492 3565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Cyp4b1-201ENSMUST00000102707 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Hdac5Q9Z2V6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Hdac5Q9Z2V6 Ighv7-2-201ENSMUST00000103462 354 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms