Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm16099-202ENSMUST00000151873 660 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Arid3b-204ENSMUST00000164010 1259 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm18856-203ENSMUST00000222015 483 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 AC125070.1-201ENSMUST00000223523 555 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 AC166344.1-201ENSMUST00000223745 674 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Olfr584-201ENSMUST00000098210 964 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Vps18-201ENSMUST00000037280 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dyrk4-202ENSMUST00000078521 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Riox2-202ENSMUST00000120667 2200 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Kat6b-201ENSMUST00000069648 7649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gfm2-202ENSMUST00000042084 3074 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Trim46-203ENSMUST00000107464 3252 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Habp2-201ENSMUST00000078284 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Zfp454-201ENSMUST00000050595 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Camk2b-207ENSMUST00000101586 1590 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sertad3-201ENSMUST00000068641 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Aktip-203ENSMUST00000120349 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pex13-201ENSMUST00000020523 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 4930522L14Rik-201ENSMUST00000100937 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Prkcd-205ENSMUST00000112207 2139 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mageb17-ps-201ENSMUST00000117902 919 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dnajc17-201ENSMUST00000038439 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Gm3402-202ENSMUST00000077133 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Sipa1l2-202ENSMUST00000212168 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Ctsb-201ENSMUST00000006235 4743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
Cldn8Q9Z260 Dlec1-206ENSMUST00000140326 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Gm42141-201ENSMUST00000196534 2172 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Znrf3-203ENSMUST00000172492 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Slc10a6-201ENSMUST00000031263 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Cldn8Q9Z260 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.4 ms