Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm39117-201ENSMUST00000207692 1569 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Hkdc1-201ENSMUST00000020277 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Sik2-205ENSMUST00000176663 4107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm35363-201ENSMUST00000209330 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm16459-201ENSMUST00000121443 686 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm13827-201ENSMUST00000148801 372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Krtcap2-204ENSMUST00000168900 582 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pax5-212ENSMUST00000173733 885 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 4930557B06Rik-201ENSMUST00000200193 381 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 9330199G10Rik-202ENSMUST00000221607 1728 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 CT025689.1-201ENSMUST00000225214 283 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Atp5j2-201ENSMUST00000037056 540 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Hrc-201ENSMUST00000085351 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Nek3-204ENSMUST00000178324 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mbtps2-203ENSMUST00000112522 3891 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mbtps2-208ENSMUST00000179062 3890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Capn3-205ENSMUST00000110719 2778 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Moxd2-201ENSMUST00000031937 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Slc38a5-201ENSMUST00000033512 1868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mid1-ps1-201ENSMUST00000167967 1248 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm9625-201ENSMUST00000180422 955 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm37436-201ENSMUST00000193842 1085 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm43564-201ENSMUST00000196185 211 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm32591-203ENSMUST00000204725 696 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm7192-201ENSMUST00000210793 1137 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC114573.1-201ENSMUST00000224120 1210 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 n-R5s71-201ENSMUST00000093668 119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Gm42970-201ENSMUST00000196407 1352 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Lgr5Q9Z1P4 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
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