Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Tifa-205ENSMUST00000171621 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Glyctk-202ENSMUST00000112543 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Ism2-201ENSMUST00000051601 1350 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm12992-201ENSMUST00000124738 4493 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Gm37954-201ENSMUST00000195400 2071 ntBASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.76
TapbpQ9R233 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Cntnap4-201ENSMUST00000034225 4848 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm3716-202ENSMUST00000198582 2879 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm37031-201ENSMUST00000195487 2530 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Als2cl-201ENSMUST00000084926 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm13822-201ENSMUST00000127563 346 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Pbld1-204ENSMUST00000219045 602 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Ufc1-201ENSMUST00000080001 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 1110051M20Rik-202ENSMUST00000094835 1498 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Srrm2-201ENSMUST00000088621 8564 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm3139-202ENSMUST00000201138 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm3183-203ENSMUST00000202911 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Pdik1l-203ENSMUST00000105877 4674 ntTSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Dnajc5-203ENSMUST00000108797 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Fhit-204ENSMUST00000161302 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
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TapbpQ9R233 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Zmiz1-208ENSMUST00000162645 7482 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
TapbpQ9R233 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
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