Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm19015-201ENSMUST00000184002 1189 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam168a-204ENSMUST00000207564 1083 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gtf2a1-202ENSMUST00000063314 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Als2-204ENSMUST00000163058 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bcl2l14-201ENSMUST00000032321 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Cyp2a22-201ENSMUST00000170227 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm9035-201ENSMUST00000218318 1697 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gabarapl2-201ENSMUST00000034428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tln1-201ENSMUST00000030187 8393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tnc-202ENSMUST00000107371 2928 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pbrm1-207ENSMUST00000112095 7907 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Hr-205ENSMUST00000163060 5278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 4631405J19Rik-204ENSMUST00000145926 936 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Calcoco1-204ENSMUST00000171838 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gng8-202ENSMUST00000205459 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC154680.1-201ENSMUST00000224376 859 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 AC154589.2-201ENSMUST00000228847 251 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Bhlha15-201ENSMUST00000060747 3494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pip4k2b-201ENSMUST00000018691 5053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pphln1-201ENSMUST00000049122 4023 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gtf2i-224ENSMUST00000174772 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Sparc-209ENSMUST00000216313 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
Tlr5Q9JLF7 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mov10l1-203ENSMUST00000146993 4133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Tmcc1-210ENSMUST00000204353 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Spata7-201ENSMUST00000048402 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gngt2-205ENSMUST00000107711 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mrps17-204ENSMUST00000119604 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm15726-201ENSMUST00000144738 509 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Bloc1s1-205ENSMUST00000153731 613 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 C630004L07Rik-201ENSMUST00000193236 1275 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm45285-201ENSMUST00000210418 749 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm40639-201ENSMUST00000214642 625 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 AC114645.1-201ENSMUST00000215831 187 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Mitd1-201ENSMUST00000027257 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Tlr5Q9JLF7 Gm6685-201ENSMUST00000042595 764 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.1 ms