Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm16308-201ENSMUST00000162171 940 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm28388-201ENSMUST00000186262 437 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm4753-201ENSMUST00000188327 1255 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm42657-201ENSMUST00000201746 211 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm44158-201ENSMUST00000203881 505 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Calm1-201ENSMUST00000001204 3987 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm37014-201ENSMUST00000194723 2253 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Prpf19-203ENSMUST00000179297 6035 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Npl-201ENSMUST00000041874 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Epb41l1-206ENSMUST00000109577 6251 ntTSL 5 BASIC10.8□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Als2cl-206ENSMUST00000155014 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Sgk1-213ENSMUST00000164659 2602 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Stat3-202ENSMUST00000103114 6042 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Flvcr2-201ENSMUST00000040461 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Prdm9-205ENSMUST00000147532 1447 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ablim1-213ENSMUST00000111559 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Rad18-204ENSMUST00000113182 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ctrc-202ENSMUST00000105781 784 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ssc4d-202ENSMUST00000111150 459 ntTSL 2 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Upk3aQ9JKX8 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 4930447N08Rik-203ENSMUST00000198879 1157 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
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Upk3aQ9JKX8 Myoz2-201ENSMUST00000029761 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm10109-201ENSMUST00000072123 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pdcd10-205ENSMUST00000161137 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Dmbt1-206ENSMUST00000213064 5779 ntTSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Kdm2a-201ENSMUST00000047898 8578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Wars-201ENSMUST00000109848 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Yeats2-202ENSMUST00000115560 6116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Gpcpd1-202ENSMUST00000060955 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Upk3aQ9JKX8 Pcdhb21-201ENSMUST00000061405 4705 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms