Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rpl17-ps3-201ENSMUST00000221295 556 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Pde6b-201ENSMUST00000031456 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Fan1-201ENSMUST00000163289 3460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Amz1-202ENSMUST00000120630 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Fhdc1-201ENSMUST00000091002 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Syn2-203ENSMUST00000203450 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Dclk2-202ENSMUST00000191752 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Top3a-204ENSMUST00000120417 2318 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Arhgap33os-201ENSMUST00000124276 2648 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Chrac1Q9JKP8 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Slc10a7-201ENSMUST00000034111 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ighv1-81-201ENSMUST00000103548 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Chrac1Q9JKP8 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm18038-201ENSMUST00000197900 485 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Acsm5-207ENSMUST00000207813 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tsga8-201ENSMUST00000049420 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Chrac1Q9JKP8 Adm2-201ENSMUST00000066991 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Olfr171-201ENSMUST00000079891 945 ntAPPRIS P2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Unc45a-202ENSMUST00000107368 3635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
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Chrac1Q9JKP8 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rwdd3-204ENSMUST00000106466 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
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Chrac1Q9JKP8 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Nucks1-201ENSMUST00000062264 5998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Nfic-203ENSMUST00000105321 6237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Dzip1l-204ENSMUST00000112886 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Slfn1-201ENSMUST00000037994 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm12296-201ENSMUST00000144922 3220 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Togaram1-201ENSMUST00000066296 6372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Tcp10a-202ENSMUST00000128533 2589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Caprin1-202ENSMUST00000111147 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Myh10-203ENSMUST00000102611 7791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Fam13c-201ENSMUST00000062883 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Psat1-205ENSMUST00000162053 2291 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Spint5-201ENSMUST00000103097 443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm12012-201ENSMUST00000118857 1066 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Spint5-202ENSMUST00000180193 443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Chrac1Q9JKP8 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms