Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Ceacam9-201ENSMUST00000001984 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ikbkg-204ENSMUST00000114128 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ndst3-202ENSMUST00000124803 1917 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tpst1-202ENSMUST00000118993 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cfap61-201ENSMUST00000116398 1561 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4930579F01Rik-202ENSMUST00000199293 1598 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm21987-201ENSMUST00000119704 456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Atad3aos-202ENSMUST00000150777 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm18014-201ENSMUST00000183369 817 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5178-201ENSMUST00000219380 898 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC129975.1-201ENSMUST00000224816 592 ntBASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Crygf-201ENSMUST00000027082 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Krtap12-1-201ENSMUST00000092370 656 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Sept9-205ENSMUST00000106354 3869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gipr-201ENSMUST00000094790 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 4921507G05Rik-201ENSMUST00000181348 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Arhgef2-203ENSMUST00000170653 4238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Trav12-3-201ENSMUST00000103657 442 ntAPPRIS P1 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm14255-201ENSMUST00000128846 248 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm13709-201ENSMUST00000138573 614 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm12052-201ENSMUST00000142151 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm9574-201ENSMUST00000173127 845 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm6606-201ENSMUST00000193613 947 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Calca-207ENSMUST00000206853 720 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 AC112146.1-201ENSMUST00000221641 733 ntTSL 3 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm43167-201ENSMUST00000202001 1606 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rabep1-203ENSMUST00000100928 3860 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Pgpep1-201ENSMUST00000070173 4883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Txndc9-208ENSMUST00000195247 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tmeff2-202ENSMUST00000114565 2718 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ccdc90b-202ENSMUST00000085017 1494 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Bpifb4-201ENSMUST00000099181 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mfsd9-201ENSMUST00000039672 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm5257-201ENSMUST00000121823 790 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Aamdc-206ENSMUST00000136757 789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm24328-201ENSMUST00000175104 67 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm25951-201ENSMUST00000175330 64 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm15469-201ENSMUST00000201750 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm8162-201ENSMUST00000213951 665 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ly86-201ENSMUST00000021860 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Adgre5-201ENSMUST00000002964 2986 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Rin3-201ENSMUST00000056950 3892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Mocs2-216ENSMUST00000184672 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Gm42499-201ENSMUST00000196193 1412 ntBASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Olfr171-202ENSMUST00000205467 1406 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
OtofQ9ESF1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms