Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC33

Hmg20a, High mobility group protein 20A, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmg20aQ9DC33 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Itgad-204ENSMUST00000177111 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sdk1-201ENSMUST00000074546 7063 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Nectin4-203ENSMUST00000111286 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Commd1-204ENSMUST00000159081 4508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm10465-201ENSMUST00000223133 3334 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Sept9-204ENSMUST00000106349 2932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Shank2-201ENSMUST00000097929 4418 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pomgnt1-204ENSMUST00000120083 2953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tktl2-202ENSMUST00000183187 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm43517-201ENSMUST00000110746 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ppp2r5c-205ENSMUST00000221715 2367 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Chd1-201ENSMUST00000024620 3196 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dgkh-201ENSMUST00000074729 3967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm42571-201ENSMUST00000201197 2464 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Kcnj15-206ENSMUST00000113859 5046 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Suclg2-204ENSMUST00000204224 3367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Slc6a5-203ENSMUST00000207753 6966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lox-202ENSMUST00000171470 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dync1h1-201ENSMUST00000018851 14342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Txlng-204ENSMUST00000112316 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm37003-201ENSMUST00000194702 2827 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 A1cf-201ENSMUST00000075838 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rnf43-202ENSMUST00000092800 4037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tnk2-204ENSMUST00000115123 4225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mefv-202ENSMUST00000100222 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Casz1-201ENSMUST00000094464 4349 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rnf123-207ENSMUST00000160249 4426 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Mpo-203ENSMUST00000121303 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm15631-201ENSMUST00000142962 2436 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Apobr-201ENSMUST00000039522 3685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Fam166b-203ENSMUST00000107929 865 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AI480526-203ENSMUST00000160099 1017 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm27023-201ENSMUST00000182372 285 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC141438.2-201ENSMUST00000215068 271 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Hmg20aQ9DC33 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 AC158779.1-201ENSMUST00000228912 3861 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Traip-201ENSMUST00000049348 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Gramd1b-202ENSMUST00000118159 2781 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Lhfpl2-201ENSMUST00000054274 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Optc-205ENSMUST00000153617 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Lpxn-201ENSMUST00000025601 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Hmg20aQ9DC33 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
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