Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Vps54-202ENSMUST00000109578 4273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ebf2-202ENSMUST00000176029 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ppil2-202ENSMUST00000115719 838 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm14270-201ENSMUST00000118388 846 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm3828-201ENSMUST00000121817 257 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm37638-201ENSMUST00000194337 1123 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 P2rx7-203ENSMUST00000100737 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm5739-201ENSMUST00000208601 1703 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Tnk1-201ENSMUST00000001626 2778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Fam3a-201ENSMUST00000015427 1427 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Olfr601-203ENSMUST00000214110 2196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Olfr601-204ENSMUST00000217416 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Smndc1-201ENSMUST00000025997 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Map4-214ENSMUST00000199498 4055 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Abi1-209ENSMUST00000140164 3403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12986-201ENSMUST00000119037 967 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm14266-202ENSMUST00000146542 1067 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm17798-201ENSMUST00000182282 1035 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm43634-201ENSMUST00000202671 675 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm3726-201ENSMUST00000203110 785 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 AC154305.2-201ENSMUST00000225813 901 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Shc1-201ENSMUST00000039110 3250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Zmiz2-205ENSMUST00000109787 4116 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Sparc-207ENSMUST00000213866 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Foxn2-201ENSMUST00000112238 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Pax5-205ENSMUST00000107827 1315 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Traf7-202ENSMUST00000088464 2504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Lrch1-201ENSMUST00000088970 4694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm45206-201ENSMUST00000206885 2285 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Serf2-202ENSMUST00000110615 876 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm11728-201ENSMUST00000150628 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm17116-201ENSMUST00000169175 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Krtap4-13-201ENSMUST00000050106 815 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Fbxo15-201ENSMUST00000037718 1437 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Gm15541-201ENSMUST00000147449 2713 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp869-201ENSMUST00000080987 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Plxnb2-201ENSMUST00000060808 6394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Abcc10-204ENSMUST00000167360 4866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Airn-205ENSMUST00000161890 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 3110062M04Rik-203ENSMUST00000115007 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Swt1Q9DBQ9 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms