Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 n-R5s64-201ENSMUST00000102019 119 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm4909-201ENSMUST00000118749 794 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Bhmt-ps1-201ENSMUST00000178743 1224 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Mbd1-202ENSMUST00000224047 2838 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Epn3-202ENSMUST00000127305 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Med27Q9DB40 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Pdlim2-201ENSMUST00000022681 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Dnajb6-203ENSMUST00000114839 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Baiap3-206ENSMUST00000182825 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Med12l-201ENSMUST00000029393 2295 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Eef1a1-201ENSMUST00000042235 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm9915-201ENSMUST00000066196 1383 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm15352-201ENSMUST00000118696 270 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Mrpl23-ps1-201ENSMUST00000173086 580 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm18367-201ENSMUST00000176139 600 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm43186-201ENSMUST00000198130 824 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Acsl4-201ENSMUST00000033634 5280 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Med27Q9DB40 Gm6793-201ENSMUST00000071732 1604 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms