Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Neil1-201ENSMUST00000034842 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ptpn11-201ENSMUST00000054547 5535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Snw1-201ENSMUST00000021428 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tns1-209ENSMUST00000187691 2813 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Ndor1-201ENSMUST00000100329 4517 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Syt14-201ENSMUST00000016344 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Brsk1-204ENSMUST00000205666 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Lmo7-205ENSMUST00000159314 5774 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Pop5Q9DB28 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Pcdh18-201ENSMUST00000035931 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cxcl12-203ENSMUST00000112871 3132 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Dhdds-201ENSMUST00000012262 3133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Hnrnpc-210ENSMUST00000228232 2535 ntAPPRIS P5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Synpr-201ENSMUST00000070323 2541 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Snord17-201ENSMUST00000104526 238 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Aldh16a1-206ENSMUST00000209963 3537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Tmc5-202ENSMUST00000098088 3774 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Alms1-ps2-202ENSMUST00000161983 2290 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Iqce-201ENSMUST00000041783 6037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cdc20b-203ENSMUST00000181117 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Sez6l-202ENSMUST00000079491 5857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Zmym3-209ENSMUST00000121520 5564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Nrg1-212ENSMUST00000208598 1778 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Lrmda-201ENSMUST00000075639 908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Lhx9-204ENSMUST00000112026 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Scn8a-201ENSMUST00000082209 11293 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Ano10-203ENSMUST00000214409 2384 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Pop5Q9DB28 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms