Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Med12l-203ENSMUST00000040846 3747 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm12224-201ENSMUST00000124047 567 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm13027-201ENSMUST00000135858 241 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm5526-201ENSMUST00000153604 423 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Lockd-205ENSMUST00000185152 496 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm44507-201ENSMUST00000206249 343 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 BC049987-201ENSMUST00000213859 918 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm14005-208ENSMUST00000223654 681 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Psca-201ENSMUST00000023265 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rnasek-201ENSMUST00000040428 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm39204-201ENSMUST00000210045 1307 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Olfr434-203ENSMUST00000216562 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Arrb2-201ENSMUST00000079056 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Lonp2-207ENSMUST00000163987 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm24074-201ENSMUST00000158178 260 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm11942-201ENSMUST00000180255 345 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm42732-201ENSMUST00000202887 1197 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm45670-201ENSMUST00000211382 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Krtap2-4-201ENSMUST00000074926 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm7735-201ENSMUST00000089098 159 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm6040-201ENSMUST00000095430 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Prr27-202ENSMUST00000101056 1337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Prr27-201ENSMUST00000002310 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Cxcl11-201ENSMUST00000077820 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ephb2-203ENSMUST00000105846 3653 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm23595-201ENSMUST00000104306 130 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Trub2-203ENSMUST00000113807 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Mir1249-201ENSMUST00000116791 98 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Zfp783-204ENSMUST00000130490 4419 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm37058-201ENSMUST00000193393 1644 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Gm43097-201ENSMUST00000196867 151 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Ghrl-205ENSMUST00000204163 447 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC156631.1-201ENSMUST00000215213 1358 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 AC164099.1-201ENSMUST00000227780 333 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 4933407L21Rik-201ENSMUST00000027426 1146 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Slc52a2Q9D8F3 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms