Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Olfr889-201ENSMUST00000072290 945 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Sh2d2a-202ENSMUST00000107581 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Gm14685-202ENSMUST00000179117 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
PrameQ9D4Z5 Abcg2-202ENSMUST00000114294 2178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tgif1-201ENSMUST00000059775 1631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ttc25-201ENSMUST00000006976 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Bbs1-201ENSMUST00000053506 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Swap70-201ENSMUST00000033325 4027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Pcgf2-206ENSMUST00000169807 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Flot2-202ENSMUST00000073660 2568 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gtf2e1-201ENSMUST00000023525 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 D6Ertd527e-201ENSMUST00000170124 2161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Krtap4-6-201ENSMUST00000100476 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Igkv3-12-201ENSMUST00000103396 359 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Rpl35a-205ENSMUST00000115079 510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Gm15523-201ENSMUST00000160463 439 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm42953-201ENSMUST00000199363 581 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 B230303A05Rik-204ENSMUST00000223006 748 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Fkbpl-201ENSMUST00000036720 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Olfr284-201ENSMUST00000063289 918 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Nfe2l1-211ENSMUST00000167149 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Crybg2-201ENSMUST00000121391 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tpra1-219ENSMUST00000203345 3359 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 AC127597.1-201ENSMUST00000225697 5711 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rnf13-210ENSMUST00000200497 2573 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Prag1-201ENSMUST00000110492 4780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Acsm2-202ENSMUST00000098084 2099 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Btg2-201ENSMUST00000020692 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
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PrameQ9D4Z5 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Entpd8-203ENSMUST00000114380 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm9133-201ENSMUST00000118289 540 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ddt-201ENSMUST00000001716 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Ly6c1-202ENSMUST00000179762 838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Atp5h-201ENSMUST00000043931 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 4921508M14Rik-201ENSMUST00000061679 1099 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Mirlet7i-201ENSMUST00000083472 85 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Stom-201ENSMUST00000028241 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
PrameQ9D4Z5 Sgca-202ENSMUST00000103162 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms