Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Fbxo8-201ENSMUST00000040218 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Recql-202ENSMUST00000100832 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gpc6-202ENSMUST00000088483 3488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm13398-201ENSMUST00000149378 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Apbb1-217ENSMUST00000191011 2712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Limd2-203ENSMUST00000106875 936 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm8876-201ENSMUST00000120768 1122 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ndufaf5-201ENSMUST00000044825 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tcf7l2-207ENSMUST00000111653 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nxpe5-201ENSMUST00000110929 2312 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Kcns2-202ENSMUST00000228725 4906 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Lamb1-201ENSMUST00000002979 5784 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ttll5-202ENSMUST00000040273 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Taf3-204ENSMUST00000114909 4897 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Sptbn5-204ENSMUST00000156159 3625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 L3mbtl1-201ENSMUST00000035751 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Arhgef10-202ENSMUST00000110800 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm35021-201ENSMUST00000210105 2329 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Lage3-201ENSMUST00000015433 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm26636-201ENSMUST00000181696 1115 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm27239-201ENSMUST00000184638 642 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dmrt1i-203ENSMUST00000197311 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm43349-201ENSMUST00000200047 503 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm40437-201ENSMUST00000222338 767 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Zfp280b-201ENSMUST00000061617 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Hacl1-212ENSMUST00000167066 1566 ntTSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Ttll13-201ENSMUST00000058266 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 A330033J07Rik-201ENSMUST00000180921 2816 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Nrip3-201ENSMUST00000033331 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Snx20Q9D2Y5 Phip-201ENSMUST00000034787 10756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms