Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 5730455P16Rik-204ENSMUST00000179332 4536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Col6a5-203ENSMUST00000190193 9289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Uimc1-204ENSMUST00000127195 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Sp100-213ENSMUST00000155094 1666 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Actbl2-201ENSMUST00000054716 2737 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ralgps1-202ENSMUST00000091039 2738 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Spg20-202ENSMUST00000107971 3567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tmsb10-201ENSMUST00000114048 623 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm13297-201ENSMUST00000120205 934 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm44793-201ENSMUST00000136923 582 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1700018A23Rik-201ENSMUST00000201350 398 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Trappc4-206ENSMUST00000217163 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Prr5l-210ENSMUST00000171088 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Oas1h-201ENSMUST00000072476 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 H2-Ob-204ENSMUST00000173764 1319 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Zfp92-201ENSMUST00000033740 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Zmym6-201ENSMUST00000046751 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tcn2-207ENSMUST00000109993 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Nmbr-201ENSMUST00000020015 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Card14-201ENSMUST00000053245 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Lgals12-201ENSMUST00000079902 2590 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm12200-201ENSMUST00000144876 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ercc8-201ENSMUST00000054835 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tat-201ENSMUST00000001720 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AA474408-201ENSMUST00000098110 3339 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tmco3-201ENSMUST00000045229 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gramd1b-214ENSMUST00000216821 7445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Ctcfl-201ENSMUST00000094287 3217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Tsix-202ENSMUST00000211291 3263 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Rhox2c-201ENSMUST00000115190 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pdxk-ps-202ENSMUST00000160550 876 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1810008B01Rik-201ENSMUST00000162325 829 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm5706-201ENSMUST00000181525 993 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Svip-203ENSMUST00000209193 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 G3bp1-201ENSMUST00000018727 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Olfr6-203ENSMUST00000213651 4457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Mfn2-204ENSMUST00000105716 4241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Tmed11Q9D2R4 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms