Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Apc2-201ENSMUST00000020349 9074 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Sfrp4-203ENSMUST00000222464 4049 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm11560-201ENSMUST00000117567 948 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm22379-201ENSMUST00000157480 131 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Pom121l2-201ENSMUST00000017126 2960 ntAPPRIS P4 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 B230110C06Rik-201ENSMUST00000181388 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Mmp7-201ENSMUST00000018767 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm35986-201ENSMUST00000197370 655 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm6423-201ENSMUST00000204315 934 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm45641-201ENSMUST00000209775 452 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm18499-201ENSMUST00000220808 1021 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 4930449E01Rik-201ENSMUST00000022711 595 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Lxn-201ENSMUST00000058981 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Sept4-202ENSMUST00000063156 1245 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tcf4-251ENSMUST00000202474 1810 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Nom1-201ENSMUST00000001611 9219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Armc3-202ENSMUST00000114640 2818 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Scn5a-201ENSMUST00000065196 8287 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Fga-201ENSMUST00000029630 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Myo7a-203ENSMUST00000107127 6806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Slc38a5-203ENSMUST00000115591 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Hsd3b1-201ENSMUST00000029465 1663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Edc4-202ENSMUST00000119261 4645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Dcun1d2-201ENSMUST00000045366 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tex2-201ENSMUST00000042780 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rbm10-205ENSMUST00000115375 3698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 4833422M21Rik-202ENSMUST00000181252 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm2000-201ENSMUST00000102782 445 ntAPPRIS P1 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm11884-201ENSMUST00000131639 641 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm11789-203ENSMUST00000140645 737 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 AC238811.4-201ENSMUST00000178019 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 AC238940.3-201ENSMUST00000178830 1246 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm19587-201ENSMUST00000191395 545 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 1700086D15Rik-201ENSMUST00000020855 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
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Pramef12Q9D2F1 Gm4065-202ENSMUST00000218911 986 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Foxp1-221ENSMUST00000176632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Foxp1-222ENSMUST00000176850 2339 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ccl22-201ENSMUST00000034231 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Kif3b-201ENSMUST00000028977 5635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Pdzk1-201ENSMUST00000058865 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Nr5a1-201ENSMUST00000028084 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Wnt7b-203ENSMUST00000167968 3408 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 F11-201ENSMUST00000034064 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Rims4-201ENSMUST00000044734 4962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Dock6-201ENSMUST00000034728 6467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm4900-201ENSMUST00000222046 1628 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Tapbpl-201ENSMUST00000043422 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pramef12Q9D2F1 March7-202ENSMUST00000102747 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms