Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Gm19299-202ENSMUST00000215724 1435 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Nox4-201ENSMUST00000032781 3753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ap1b1-203ENSMUST00000109897 3942 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zfp68-203ENSMUST00000110905 4749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm43152-201ENSMUST00000202495 1638 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Srrt-201ENSMUST00000040873 3024 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Fyb2-202ENSMUST00000106804 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tctn1-201ENSMUST00000111738 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tenm3-206ENSMUST00000190840 8663 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rpl22-204ENSMUST00000139685 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm11956-201ENSMUST00000119525 512 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm11573-201ENSMUST00000119956 394 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700088E04Rik-206ENSMUST00000187550 1168 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm43667-201ENSMUST00000198616 1095 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Saa-ps-201ENSMUST00000211148 320 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Inpp4a-203ENSMUST00000114933 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Kcnma1-212ENSMUST00000188285 4440 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ass1-201ENSMUST00000102840 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cct3-204ENSMUST00000164166 1804 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Zfp629-202ENSMUST00000084564 5829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cacna1c-205ENSMUST00000112825 7577 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 4930463O16Rik-201ENSMUST00000020222 2088 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ktn1-220ENSMUST00000190252 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Cit-202ENSMUST00000102560 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm43401-201ENSMUST00000198829 394 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Spns3Q9D232 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms