Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cyp4f40-201ENSMUST00000165061 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm38273-201ENSMUST00000194987 2382 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Sept11-201ENSMUST00000074733 5028 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34785-201ENSMUST00000222571 4582 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ighv10-1-201ENSMUST00000103492 359 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Banf2-202ENSMUST00000110032 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13019-201ENSMUST00000120000 276 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12316-201ENSMUST00000125853 406 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27191-201ENSMUST00000145973 448 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 AU015836-205ENSMUST00000163458 911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Adora3-202ENSMUST00000164730 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm9372-201ENSMUST00000168454 430 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Anp32e-206ENSMUST00000169426 915 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt12-203ENSMUST00000174122 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Sbsn-205ENSMUST00000182721 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm34379-201ENSMUST00000195036 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31274-201ENSMUST00000197356 229 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 9530062K07Rik-201ENSMUST00000203332 787 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Klk1b15-ps-201ENSMUST00000206273 715 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 4930543N07Rik-202ENSMUST00000209503 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Gm31513-201ENSMUST00000223261 684 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Nnmt-201ENSMUST00000034808 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Banf2-201ENSMUST00000037722 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Slc10a1-202ENSMUST00000218162 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gtf2e1Q9D0D5 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 A230077H06Rik-202ENSMUST00000189574 2477 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm7964-201ENSMUST00000051522 1378 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Hddc3-201ENSMUST00000032747 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ltc4s-201ENSMUST00000101265 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt12os-201ENSMUST00000145848 939 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13572-201ENSMUST00000153675 559 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17214-201ENSMUST00000164501 541 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm42430-201ENSMUST00000197209 616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Prss51-204ENSMUST00000224112 1042 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cib4-201ENSMUST00000065486 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Snx33-201ENSMUST00000050916 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm20687-203ENSMUST00000185121 4242 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cast-211ENSMUST00000223206 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cast-212ENSMUST00000223309 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zmynd8-220ENSMUST00000170272 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 1700125H20Rik-202ENSMUST00000100681 687 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Art5-202ENSMUST00000106934 843 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11578-201ENSMUST00000118530 459 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Saxo2-202ENSMUST00000126478 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Polr3c-205ENSMUST00000141377 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17070-201ENSMUST00000170463 784 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Crygd-201ENSMUST00000045028 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Strip2-205ENSMUST00000151738 5281 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cpeb1-209ENSMUST00000178892 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cops3-201ENSMUST00000019517 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Kctd10-202ENSMUST00000102581 3103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gtf2e1Q9D0D5 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms