Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Synrg-202ENSMUST00000092834 7115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tubgcp6-202ENSMUST00000109353 7635 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tacc2-208ENSMUST00000207549 3492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Sall1-201ENSMUST00000034090 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ces3b-201ENSMUST00000074403 1907 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Agtrap-201ENSMUST00000030865 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm24990-201ENSMUST00000157406 323 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gstp-ps-201ENSMUST00000195526 631 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Cdc34-208ENSMUST00000219791 799 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Lgals12-202ENSMUST00000099729 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc23a1-201ENSMUST00000025212 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ikbkg-201ENSMUST00000004330 6918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Spata31d1a-201ENSMUST00000066510 4261 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Hivep3-209ENSMUST00000166542 7253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tmprss3-202ENSMUST00000114549 2872 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm37307-201ENSMUST00000193663 2621 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 4930488B22Rik-201ENSMUST00000172500 1722 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zbtb8b-202ENSMUST00000106046 3323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Pcdhb9-201ENSMUST00000057228 3055 ntAPPRIS P1 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Fbp1-201ENSMUST00000092888 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Fam84a-201ENSMUST00000020926 4164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm43274-201ENSMUST00000202545 5000 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Sorbs3-201ENSMUST00000022682 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Knop1-206ENSMUST00000126792 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 A330032B11Rik-201ENSMUST00000180609 1919 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Sipa1l2-201ENSMUST00000108775 6365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Zswim9-203ENSMUST00000119558 3111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Colec12-201ENSMUST00000040069 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Ankrd33-201ENSMUST00000070875 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Morc2a-201ENSMUST00000093389 5085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Erbin-203ENSMUST00000091269 6224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Dhx8-201ENSMUST00000039152 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm43915-201ENSMUST00000203013 5037 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Atp10d-202ENSMUST00000126664 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tec-201ENSMUST00000071944 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm16070-201ENSMUST00000127328 5210 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm13563-201ENSMUST00000125518 643 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm454-201ENSMUST00000160126 751 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Tmem267-202ENSMUST00000176171 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
Mrpl55Q9CZ83 Gm25700-201ENSMUST00000177693 110 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms