Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTH6

Fcf1, rRNA-processing protein FCF1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcf1Q9CTH6 Gpr139-201ENSMUST00000084650 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Zfp467-204ENSMUST00000114559 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Sun1-203ENSMUST00000100517 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tef-202ENSMUST00000109553 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm25076-201ENSMUST00000104098 132 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm13844-201ENSMUST00000134541 581 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Hmgn3-201ENSMUST00000161796 862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Vmn1r-ps19-201ENSMUST00000177008 926 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ly6e-203ENSMUST00000185861 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 1700072G22Rik-201ENSMUST00000189460 548 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm43177-201ENSMUST00000197032 1107 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 C330004P14Rik-201ENSMUST00000218833 628 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Hmgb1-ps11-201ENSMUST00000221749 621 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC117949.2-201ENSMUST00000225900 584 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Hopx-201ENSMUST00000081964 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm10770-201ENSMUST00000099418 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tgfb2-206ENSMUST00000195201 3485 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Vcp-201ENSMUST00000030164 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Pstpip2-201ENSMUST00000114741 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm19210-201ENSMUST00000199562 1350 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm42852-201ENSMUST00000202649 1379 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AU015791-201ENSMUST00000223443 1457 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Phyhipl-201ENSMUST00000046513 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Kcne2-202ENSMUST00000113971 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Matn2-201ENSMUST00000022947 3551 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Morf4l2-204ENSMUST00000113097 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Olfr1094-201ENSMUST00000105211 1147 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm16071-201ENSMUST00000119589 793 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Dmrtc1a-204ENSMUST00000121197 1067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm11244-201ENSMUST00000121243 237 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Mfsd14b-203ENSMUST00000155487 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm6918-201ENSMUST00000167622 1222 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm28351-201ENSMUST00000186261 559 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm37678-201ENSMUST00000192908 1146 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm9645-201ENSMUST00000197131 792 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 CT485606.1-201ENSMUST00000213187 878 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Fcf1Q9CTH6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms