Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ56

Use1, Vesicle transport protein USE1, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Use1Q9CQ56 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Svil-211ENSMUST00000143254 6594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm4419-201ENSMUST00000180671 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rims1-203ENSMUST00000097809 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rad51ap2-201ENSMUST00000124065 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ltbp1-203ENSMUST00000112516 5140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 9130204K15Rik-202ENSMUST00000150312 696 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm8100-201ENSMUST00000182906 988 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Olfr1227-ps1-201ENSMUST00000215627 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm18165-201ENSMUST00000217426 928 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rpgrip1-202ENSMUST00000111603 5380 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13910-201ENSMUST00000121752 1428 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 4632415L05Rik-202ENSMUST00000198527 4087 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Krba1-201ENSMUST00000031815 3685 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Myh13-201ENSMUST00000081911 5817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Dnmbp-206ENSMUST00000212592 3901 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm12153-201ENSMUST00000148504 2509 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13812-201ENSMUST00000118061 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13810-201ENSMUST00000118584 1347 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Herc6-201ENSMUST00000031817 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13135-201ENSMUST00000117628 3121 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 AC125409.1-201ENSMUST00000223213 3370 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Plpbp-203ENSMUST00000209525 5767 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Derl2-206ENSMUST00000143850 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 5730416F02Rik-201ENSMUST00000120648 812 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 AC112945.1-201ENSMUST00000226413 514 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Atp9b-201ENSMUST00000091790 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Clec14a-201ENSMUST00000062254 4571 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Itgb2-201ENSMUST00000000299 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 AC122273.1-201ENSMUST00000213634 2327 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Poldip3-202ENSMUST00000100375 3157 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Ybey-201ENSMUST00000049185 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Use1Q9CQ56 Rpap2-202ENSMUST00000112650 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms