Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Bcl11a-204ENSMUST00000118955 1505 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Taok1-202ENSMUST00000058496 12409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 A130071D04Rik-201ENSMUST00000194467 5864 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Unkl-202ENSMUST00000039734 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Furin-202ENSMUST00000120753 4332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 5730437C11Rik-201ENSMUST00000155540 242 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb1Q9CPU1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Kcnab2-207ENSMUST00000160884 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Ssxb1Q9CPU1 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Rpe65-202ENSMUST00000196999 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Tsc22d3-201ENSMUST00000055738 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Scaf1-201ENSMUST00000085383 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Polr3c-201ENSMUST00000029741 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Lingo1-201ENSMUST00000053568 3295 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Spaar-201ENSMUST00000131248 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb1Q9CPU1 Ly6g6e-201ENSMUST00000013910 1142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb1Q9CPU1 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Ssxb1Q9CPU1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 1700017B05Rik-201ENSMUST00000034846 4152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Smtn-210ENSMUST00000170588 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm40617-201ENSMUST00000218840 2420 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Git1-202ENSMUST00000100812 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Arhgap25-201ENSMUST00000071024 2635 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Zfp410-215ENSMUST00000222832 1859 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Ift88os-201ENSMUST00000149702 2016 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Gon4l-203ENSMUST00000107498 7537 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Ssxb1Q9CPU1 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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