Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

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Length 171 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Serac1-202ENSMUST00000097432 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1500012K07Rik-201ENSMUST00000181846 2345 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Suclg2-201ENSMUST00000079847 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Kat7-205ENSMUST00000107734 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cfap100-207ENSMUST00000165673 2072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Abhd18-201ENSMUST00000108077 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Fam180a-201ENSMUST00000051176 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tardbp-209ENSMUST00000165113 6495 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tmcc2-201ENSMUST00000045473 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Flna-202ENSMUST00000101454 8345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hspa12a-201ENSMUST00000066285 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cish-204ENSMUST00000168260 2742 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Atp11c-202ENSMUST00000101527 6044 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Adcy7-204ENSMUST00000171456 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Pde1b-205ENSMUST00000227955 3258 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Slc25a44-203ENSMUST00000193433 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Olfr95-201ENSMUST00000060728 5129 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tasp1-203ENSMUST00000110079 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tom1l2-203ENSMUST00000093048 4864 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Myo9a-203ENSMUST00000128341 11985 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm16124-201ENSMUST00000146938 516 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cplx3-203ENSMUST00000217015 540 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1500015O10Rik-201ENSMUST00000027217 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tcaf1-202ENSMUST00000045140 5256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 5430419D17Rik-203ENSMUST00000208921 7948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Myo1c-203ENSMUST00000102505 4652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Fdft1-201ENSMUST00000054963 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Stpg3-201ENSMUST00000043774 1430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Elmod3-201ENSMUST00000070990 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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Krt88Q9CPR6 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mfap3l-204ENSMUST00000161702 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Smok3a-201ENSMUST00000085886 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 AL645745.1-201ENSMUST00000222202 5348 ntTSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Thsd4-201ENSMUST00000034829 4816 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Ccdc93-202ENSMUST00000112621 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Med17-201ENSMUST00000034411 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Pa2g4-202ENSMUST00000131728 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Tasp1-202ENSMUST00000099304 2127 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Mdm1-201ENSMUST00000020437 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm12799-201ENSMUST00000118151 2560 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Odf2l-202ENSMUST00000098538 2564 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Celsr2-201ENSMUST00000090558 10598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
Krt88Q9CPR6 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
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